Когда полезные бактерии стучатся, но никто не открывает

Исследователи из Калифорнийского технологического института обнаружили новую потенциальную причину болезни Крона, связанную с нарушением взаимодействия между генетическими факторами риска и кишечным микробиомом.

• Контекст: Известно, что пациенты с болезнью Крона часто имеют изменения как в геноме (более 200 генов риска), так и в составе кишечного микробиома. Ранее считалось, что дефектные гены мешают иммунной системе уничтожать патогенные бактерии.
• Новая гипотеза: Учёные предположили, что те же гены, важные для распознавания патогенов, также могут быть необходимы для восприятия сигналов от полезных бактерий, которые обычно способствуют противовоспалительному ответу.
• Эксперимент: Исследователи изучали, как мутации в генах ATG16L1 и NOD2 (связанных с риском болезни Крона) влияют на иммунный ответ на полезную бактерию Bacteroides fragilis.
  • У мышей с неработающими версиями этих генов лечение B. fragilis не вызывало образования защитных регуляторных Т-клеток и не облегчало симптомы кишечного заболевания.
  • Анализ иммунных клеток человека показал: клетки пациентов с защитной версией ATG16L1 реагировали на B. fragilis, а клетки пациентов с мутированной версией гена — нет.
• Вывод: Дефектные гены могут вызывать болезнь Крона двумя путями: неспособностью уничтожать патогены и нарушением получения полезных сигналов от комменсальных бактерий.
• Перспектива: Это открытие подчёркивает важность взаимосвязи генома и микробиома. Оно также указывает на необходимость учитывать генетику пациентов при назначении пробиотиков (например, B. fragilis) для повышения эффективности клинических испытаний и персонализированной медицины.

Исследование опубликовано 5 мая в журнале Science.