Выборочное "выключение" некодирующих генов: новый метод для изучения их роли в раке

Исследуя раковые клетки, учёные обнаруживают множество особенностей: присутствие большого количества определённых РНК и гиперактивность конкретных генов. Чтобы понять, связаны ли эти черты с развитием рака, проводят loss-of-function анализы — "выключают" (глушат) интересующий ген в живых клетках и наблюдают за изменениями.

Однако не хватало метода для селективного глушения некодирующих генов (тех, что не кодируют белки). Доктор Свен Дидрихс и его команда из DKFZ и Института патологии Гейдельбергского университета разработали такой метод.

В чём проблема с некодирующими генами?

Обычно для глушения используют цинк-пальцевые нуклеазы — искусственные белки, разрезающие ДНК в строго заданном месте. При восстановлении разрыва ремонтные ферменты клетки вносят мелкие дефекты, что разрушает информацию для синтеза белка. Но для некодирующих генов такие дефекты не критичны — ген остаётся функциональным и продолжает производить РНК.

Решение: молекулярная уловка

Исследователи применили трюк: они встроили в место разреза специальную сигнальную последовательность. Эта вставка заставляет клетку немедленно разрушать транскрибированную с этого гена РНК, делая её недоступной для выполнения каких-либо функций. Затем можно анализировать вызванные этим изменения в клеточной биологии.

"Мы впервые можем полностью заглушить некодирующие гены и изучить их молекулярные и клеточные функции", — пояснил Свен Дидрихс.

Учёные уверены, что высокая активность этих генов в опухолевых клетках — не случайность, и они, вероятно, играют важную роль в развитии рака. Новый метод позволит это проверить.