Ученые представили невероятно универсальный новый зонд для окрашивания ДНК

Ученые из Университета Нагои (Япония) разработали исключительно универсальный флуоресцентный краситель для ДНК, названный «Какушайн» (Kakshine). Название отдает дань уважения бывшему студенту университета, доктору Какиши Уно (Kakishi Uno), и одновременно означает «заставить ядро сиять» (по-японски ядро — «каку»).

Команда исследователей из Института трансформативных биомолекул (ITbM), включая докторов Ёсикацу Сато и Нагису Судзимото, создала краситель на основе пиридоцианина. Он впервые одновременно удовлетворяет трем ключевым требованиям:

• Высокая селективность к ДНК.

• Способность работать в видимом свете с низкой фотоксичностью.

• Применимость для широкого круга организмов.

Какушайн и его производные также совместимы с передовыми микроскопическими методами:

• Это первый краситель, позволивший провести суперразрешающую визуализацию митохондриальной ДНК в живых клетках с помощью STED-микроскопии (преодолевающей дифракционный предел света).
• Он подходит для глубокой визуализации тканей методом двухфотонного возбуждения.
• Позволяет различать ДНК разных органелл с помощью одного красителя, используя флуоресцентную lifetime-визуализацию.

Этот новый краситель превосходит возможности и решает недостатки современных флуоресцентных зондов для визуализации ДНК. Благодаря потенциальному применению в электрофорезе, количественной ПЦР и проточной цитометрии, Какушайн может стать инструментом следующего поколения для анализа ДНК в медицине и биологии.