Новый метод изучения посланников раковых клеток, ослабляющих иммунитет
Исследователи из Университета Пердью под руководством В. Энди Тао разработали метод для изучения биохимических процессов, которые могут ослаблять способность иммунной системы распознавать и уничтожать раковые клетки. Метод был успешно протестирован на клеточных линиях лейкемии и редкого рака печени.
Суть метода
Метод позволяет отслеживать и идентифицировать различные типы белков, а также широко секретируемые биопатицы — внеклеточные везикулы (EVs), которые могут влиять на эффективность иммунотерапии. EVs переносят разнообразный груз, включая рибонуклеиновую кислоту (RNA), между клетками.
Ключевая особенность подхода — фокусировка на RNA-связывающих белках, переносимых EVs, которые могут влиять на иммунные клетки-реципиенты.
Как это работает
- RNA в EVs метится синтетической органической молекулой, чувствительной к ультрафиолетовому (UV) излучению.
- Меченые EVs доставляют RNA в иммунные клетки-реципиенты.
- Воздействие UV-света вызывает сшивание (кросс-линкинг) меченой RNA с любыми близлежащими белками в клетке-реципиенте.
- Использование изотопной метки для белков клеток-реципиентов позволяет отличить их от белков, изначально содержавшихся в EVs.
Эта двухэтапная система маркировки обеспечивает низкий процент ложных открытий при высокопроизводительном (high-throughput) профилировании.
Валидация метода
Эффективность метода подтверждена в экспериментах:
- С клетками Jurkat T (модель для изучения лейкемии) для отслеживания взаимодействий между EV RNA-связывающими белками и иммунными клетками.
- С иммунными клетками, инфицированными внутрипеченочной холангиокарциномой (редкий тип рака печени). Эти клетки несут мутацию, вызывающую устойчивость к иммунотерапии, что делает их биомедицински значимыми.
Контекст и значение
Метод решает проблему систематического профилирования взаимодействий RNA-связывающих белков из EVs в клетках-реципиентах, что было ограничено низкой пропускной способностью существующих подходов.
Исследования показывают, что EVs могут переносить в иммунные клетки не только RNA-связывающие белки, но и чекпойнт-белки, играющие ключевую роль в распознавании раковых клеток иммунной системой. Это может быть одним из механизмов ослабления иммунного ответа.
«Роль внеклеточных везикул определенно признается все больше и больше», — отметил Тао.