Картирование неизвестного: Какую функцию выполняет некодирующая РНК в растениях?
ДНК содержит план жизни, но у высших организмов лишь малая её часть — это гены, кодирующие белки. Например, у человека на гены приходится всего 3% ДНК. Вопрос: какую функцию выполняют остальные 97%? Примечательно, что большинство наших знаний о геноме получено при изучении именно этого меньшинства — кодирующей ДНК.
Большая часть ДНК транскрибируется в некодирующую РНК, которая остаётся малоизученной. Постдок Питер Киндгрен из Копенгагенского центра наук о растениях (Copenhagen Plant Science Centre) при Копенгагенском университете получил 2-летний грант Marie Curie Individual Fellowship от ЕС, чтобы пролить свет на функцию этой РНК.
У растений сложная система защиты
Вместе с коллегами из лаборатории Марквардта Питер Киндгрен изучает, являются ли последовательности некодирующей РНК жизненно важными компонентами сложной регуляторной системы растений.
Растения не могут "убежать" от угроз, таких как изменения окружающей среды или насекомые-вредители. Вместо этого у них развилась сложная компенсаторная система регуляции. Некодирующая РНК может играть в этой системе важную роль.
В рамках проекта, который будет финансироваться грантом Marie Curie, основное внимание уделяется реакции на температуру.
"Я собираюсь исследовать реакцию модельного растения Arabidopsis thaliana на низкие температуры. Моя цель — проанализировать, играет ли часть некодирующей РНК роль в адаптации растения к холоду", — объясняет Питер Киндгрен.
Долгосрочным результатом исследований может стать повышение устойчивости сельскохозяйственных культур к перепадам температур.
Новая методика для изучения транскрипции
Дополнительным направлением работы станет разработка новой методики для лучшего понимания процесса транскрипции ДНК в РНК у растений.
"Новая методика позволит нам фактически увидеть динамику транскрипции в реальном времени. Мы сможем улавливать некодирующую РНК в мельчайших деталях и до того, как она деградирует. Это совершенно новый подход, который позволит нам исследовать молекулярные события в этих обильных, но всё ещё загадочных компонентах ДНК", — говорит Питер Киндгрен.