Новая модель помогает на ощупь изучить секреты молекул

Исследователям в области биологии может стать понятнее сложный мир молекулярных белков, где десятки тысяч атомов могут составлять одну молекулу. Помочь в этом может новая мягкая, прозрачная и податливая силиконовая модель, которую можно держать в руках.

Её преимущество перед традиционными компьютерными и твёрдыми моделями — в прозрачности и лёгкости манипуляций. Это помогает исследователям более интуитивно понимать структуры, положение и взаимодействия белков.

Модели позволят учёным быстро и совместно видеть, осязать и проверять идеи о молекулярных взаимодействиях и поведении белков. Эти идеи — ключ к инновациям в дизайне лекарств, так как они стимулируют обсуждение особенностей молекулярной поверхности, формы и структуры белка.

Модели также позволяют исследователям симулировать процессы "стыковки" молекул, таких как лиганды и их партнёры. Этот химический этап связывания может включать или выключать биологический процесс.

Разработка принадлежит Масару Каваками, доктору философии, биофизику из JAIST (Японский передовой институт науки и технологий). Статья опубликована в текущем выпуске журнала Американского института физики Review of Scientific Instruments.

"Поскольку моя новая модель мягкая, пользователи могут деформировать её и испытать связывание лиганда или ассоциацию белок-белок, что было невозможно с другими физическими моделями молекул. Я считаю, что моя модель может стать эффективным инструментом для обсуждения в классе или лаборатории, чтобы стимулировать вдохновляющее обучение", — сказал Каваками.