Новая методика делает in situ серийную кристаллографию более доступной

Ученые из EMBL Grenoble и Европейского центра синхротронного излучения (ESRF) разработали новый метод использования in situ серийной кристаллографии (iSX) для изучения структуры макромолекул. Метод, описанный в журнале IUCrJ, теперь работает на лучевой линии ID23-2, которой совместно управляют EMBL и ESRF.

Основные особенности метода

Главная особенность метода — работа непосредственно с кристаллизационной планшетом. Стандартная планшетка содержит в среднем 96 лунок, в каждой из которых находятся три крошечные капли с кристаллизованным белком. Вместо трудоемкого и длительного отбора и сбора «лучших» кристаллов, in situ эксперименты предполагают их скрининг и сбор данных прямо в планшетке.

Чтобы сделать этот процесс простым и эффективным, была разработана методика, основанная на использовании микро-дифрактометра в сочетании с держателем для планшетов SBS-96. Эти инструменты обеспечивают отличные технические характеристики с точки зрения точности движений и сбора данных, что критически важно для качества конечных данных. Также был создан удобный пользовательский интерфейс, адаптированный под потребности ученых.

Преимущества для структурной биологии

Основное преимущество — создание короткого пути в стандартном workflow определения структуры. Метод делает in situ эксперименты простыми и эффективными, что в конечном итоге снижает стоимость и время, необходимое для определения структуры, особенно для сложных проектов.

Это также отличный подход для проектов по открытию лекарств. Скрининг соединений прямо в планшетке станет проще и позволит проводить эксперименты при комнатной температуре. Это крайне важно для изучения мишеней в их естественном и гибком состоянии, что повысит качество и надежность конечного результата.

В перспективе метод открывает новые возможности для создания полностью автоматизированных рабочих процессов — конвейера «От планшета к 3D-модели» без вмешательства человека.

Опыт в программе ARISE

Программа стипендий ARISE предлагает отличное обучение с первого дня и уникальную особенность — обязательные стажировки (secondments) в партнерских организациях. Во время трехлетней стипендии автор тесно сотрудничал с ESRF, работал с компанией ARINAX (коммерциализирует прототипы приборов EMBL Grenoble) и спин-оффом ALPX (предоставляет услуги кристаллографии для фармацевтической и биотехнологической промышленности).

ARISE — отличный вариант для тех, кто любит работать в междисциплинарной сфере, и направлена на людей с сильным научным бэкграундом, заинтересованных в технических или методологических аспектах, или на специалистов из технической области, желающих создавать новые решения для поддержки научных проектов высокого уровня. Программа способствует налаживанию связей между людьми, академическими исследованиями и промышленными компаниями.