Учёные обнаружили гены, ошибочно классифицированные как "некодирующие белки"

Исследователи из Йельского университета выявили несколько генов, кодирующих белки, которые были ошибочно идентифицированы как некодирующие. Один из них, Aw112010, играет ключевую роль в работе иммунной системы.

Учёные предположили, что существующие методы аннотации (категоризации) генов ограничивают поиск потенциально кодирующих белки участков генома. Для проверки гипотезы они использовали модели мышей и два метода:

• Изучение взаимодействия между RNA и рибосомами — структурами, синтезирующими белки из RNA.
• Рибосомное профилирование для анализа связи рибосом с RNA.

Комбинация этих подходов позволила обнаружить ряд генов, ранее считавшихся некодирующими, которые активно продуцировали белки.

В последующих экспериментах внимание сосредоточили на гене Aw112010, который активировался при бактериальной инфекции у мышей. С помощью технологии CRISPR подтвердили, что иммунные клетки активно синтезируют белок, кодируемый этим геном, в ответ на заражение Salmonella.

Открытие указывает, что множество кодирующих белки генов и их функций ещё предстоит обнаружить. «Значительная часть важных белков была упущена из-за особенностей их аннотации», — отметил первый автор работы Руайдри Джексон. Без проверки и идентификации этих генов «невозможно полностью понять белковый геном или адекватно исследовать гены на предмет их роли в здоровье и болезнях».

Исследование под руководством иммунобиолога Ричарда Флейвелла опубликовано в журнале Nature.