Секвенирование генома раскрывает потенциальные механизмы вымирания альпийского растения в Китае
Kingdonia uniflora Balf. f. and W.W. Sm. (семейство Circaeasteraceae, порядок Ranunculales) — альпийское растение с крайне узким ареалом распространения в мире, занесённое в список исчезающих видов в Китае. Его среда обитания представляет собой экосистему первобытного леса с минимальными нарушениями.
Для изучения механизмов вымирания K. uniflora исследовательская группа под руководством профессоров Ван Хэнчана из Уханьского ботанического сада и Сунь Хана из Куньминского института ботаники собрала черновой геном K. uniflora размером 1 004,7 Мб, кодирующий 43 301 ген.
В геноме обнаружено:
- Значительное преобладание семейств генов, связанных с репарацией ДНК.
- Недостаточное представление семейств генов, отвечающих за реакцию на стресс.
- Потеря большинства пластидных ndh-генов.
Бесполая репродуктивная система в сочетании с преобладанием генов репарации ДНК привели к снижению генетического разнообразия K. uniflora.
Долгосрочная адаптация к относительно стабильной экологической среде, вероятно, вызвала:
- Недостаточное представление генов стрессового ответа.
- Функциональную потерю ndh-генов.
- Деградацию способности адаптироваться к изменяющимся условиям окружающей среды.
Результаты позволяют предположить, что изменение климата, сокращение мест обитания и низкая адаптивная способность в совокупности обусловили крайне узкое распространение K. uniflora.
Исследование под названием "Genome Sequencing of the Endangered Kingdonia uniflora (Circaeasteraceae, Ranunculales) Reveals Potential Mechanisms of Evolutionary Specialization" опубликовано в журнале iScience.