Ферменты вызывают "кипение" в каплях жидкости из ДНК: новое исследование объясняет механизм

Исследователи из Калифорнийского университета в Санта-Барбаре (UCSB) и Мюнхенского университета имени Людвига и Максимилиана (LMU) обнаружили, что добавление фермента, расщепляющего ДНК, к жидким каплям, сформированным из частиц ДНК, может вызывать их неожиданное "вскипание". Работа опубликована в Proceedings of the National Academy of Sciences.

Ключевые наблюдения:

  • Модельная система была создана с помощью методов нанотехнологий: жидкие капли, сформированные из частиц ДНК.
  • При взаимодействии с ДНК-расщепляющим ферментом капли в некоторых случаях начинали пузыриться, как кипящая вода, без какого-либо нагрева.
  • В других случаях добавление фермента приводило к плавному сжатию капель.

Раскрытый механизм:

Проведя серию точных экспериментов, ученые выявили два типа сжатия:

  1. Когда фермент разрезает ДНК только на поверхности капли.
  2. Когда фермент проникает внутрь капли.

Решающий фактор — сила связывания частиц ДНК друг с другом:

  • Сильно связанные частицы удерживают фермент снаружи (аналогично "толпе, крепко держащейся за руки").
  • Слабо связанные частицы позволяют ферменту проникнуть внутрь.

Причина "вскипания":

В слабосвязанных системах фермент, попав внутрь, начинает расщеплять ДНК изнутри. Образующиеся химические фрагменты создают осмотический эффект, притягивая воду извне. Это вызывает набухание и образование пузырей, которые, достигая поверхности, "лопаются" с выбросом фрагментов.

Значение работы:

Исследование демонстрирует сложную взаимосвязь между фундаментальными свойствами биомолекулярной жидкости и её взаимодействием с внешними компонентами. Это понимание может улучшить модели живых процессов и помочь в разработке жидких капель для использования в качестве синтетических биореакторов.