Создана первая крупномасштабная карта белковой сети растения

Ученые-сетевщики из Северо-Восточного университета совместно с междисциплинарной командой коллег в области клеточной биологии и интерактивного сбора данных создали первую крупномасштабную карту белковой сети растения.

Результаты исследования опубликованы в выпуске журнала Science от 29 июля.

Работа команды, которая в перспективе может быть применена для лечения болезней человека, таких как рак, проливает свет на взаимодействия между белками в Arabidopsis thaliana — модельном организме в биологии растений.

«Создание этой карты — важный строительный блок для понимания растений в целом и изучения биологического сходства между растениями и животными», — отметил всемирно известный ученый-сетевщик Альберт-Ласло Барабаши.

В проекте участвовали исследователи из Гарвардской медицинской школы, Института рака Дана-Фарбер, Института биологических исследований Солка, Министерства сельского хозяйства США и Департамента вычислительной техники Имперского колледжа в Лондоне.

Вклад команды Барабаши основан на более раннем исследовании, опубликованном в выпуске журнала Nature за июнь 2010 года, где был разработан математический алгоритм для выявления сообществ в сложных сетях.

В данном случае алгоритм использовали для поиска на карте сообществ взаимосвязанных белков, выполняющих одну и ту же биологическую функцию. Исследователи обнаружили более двух десятков таких сообществ.

Результаты позволяют заглянуть в эволюционный процесс внутри сетей растительных белков. Как отметил Барабаши: «Сообщества не были случайными, и у каждого была доминирующая функция, которая не возникла случайно».