Обнаружено лишь 3% потенциальных бактериальных источников лекарств

Широкомасштабный биоинформатический анализ около 170 000 бактериальных геномов показал, что на сегодняшний день обнаружено лишь три процента геномного потенциала микробных природных продуктов — химически разнообразных бактериальных метаболитов, лежащих в основе антибиотиков. Исследование координировалось профессором Надин Цимерт из Немецкого центра исследований инфекций (DZIF).

Методология исследования

Международная команда из Германии, Нидерландов и США проанализировала:

• Около 170 000 бактериальных геномов.
• Тысячи Metagenome Assembled Genomes (MAG), представляющих отдельные микробные таксоны из разных сред.

С помощью стратегии геномного майнинга были идентифицированы Biosynthetic Gene Clusters (BGCs) — кластеры генов, совместно кодирующие пути биосинтеза природных продуктов. BGC были сгруппированы в семейства ген-кластеров по сходству.

Ключевые выводы

• "Наш подход показывает, что обнаружено только три процента или даже меньше геномного потенциала для производства природных продуктов", — заявляет профессор Надин Цимерт.
• Выявлены бактериальные таксоны с высоким биосинтетическим потенциалом, включая множество неисследованных групп.
• Обнаружена неизученная биосинтетическая диверсификация даже в хорошо известных бактериальных родах, которые являются основными продуцентами антибиотиков.

Эти перспективные цели для будущих исследований могут помочь преодолеть узкие места в разработке новых эффективных антибиотиков и других лекарств.